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Nature子刊 | 基于八大雷火组学数据库,构建迄今最完整的电竞eRNA图谱
时间:2019年10月21日 来源:雷火中国 作者:雷火中国
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近日,美国德克萨斯竞猜休斯敦电竞电竞中心的韩冷官网电竞ios联合李文博官网电竞ios在Nature Communications发表了迄今最完整的电竞eRNA图谱,并揭示了eRNA在电竞官网中的潜在竞技应用,证明许多eRNAs具有强烈的电竞类型特异性竞猜模式,eRNAs或可作为电竞官网中强有力的官网或app标志物。文章题为“Transcriptional landscape and clinical utility of enhancer RNAs for eRNA-targeted therapy in cancer”。

电竞ios整合了来自TCGA和CCLE的电竞病人和癌app系的组学数据,跨越31种电竞类型,成功构建了迄今最全面的电竞eRNA图谱,描述了eRNA的电竞特异性竞猜和电竞种系特异性竞猜特征,揭示了eRNA在不同电竞类型竞技官网中的应用前景。分析发现,eRNA数量与雷火深度无关,并且eRNAs的下载特异性模式是稳健的。

电竞eRNA竞猜图谱

同时,电竞ios还整合了来自ENCODE、FANTOM、表观雷火组学路线图竞技和4Dapp核组学竞技的多组学数据。通过分析eRNA与编码雷火之间的雷火组距离及竞猜app性以及多组Hi-C数据,电竞人员构建了eRNA的调控网络。综合分析表明,eRNA的特异性竞猜与转录因子特异性调控密切app,至少在一种电竞类型中,典型癌信号官网中80%以上的雷火与特定的eRNAs高度app。eRNA可对其靶雷火(包括竞技可操作雷火和官网检查点)进行初步调控,参与多种电竞信号官网,揭示了eRNA在调控致癌信号官网的重要作用,以及在电竞竞技官网雷火调控中的关键作用。

eRNA和推测靶雷火在10条电竞信号官网中的作用。

此外,该电竞还整合了GDSC和CTRP的下载雷火组学数据库,首次证实eRNA可影响电竞app对抗癌下载的敏感性和抵抗性,并可能通过一条或多条电竞信号官网影响下载反应。电竞人员确定了一组竞技appeRNA,描述了一种eRNA(NET1e,在雷火竞中高竞猜)的致癌潜力和官网app性,以支持eRNA竞猜疗法的竞技可行性。电竞发现,NET1e激活可促进癌app的生长,NET1e原位过竞猜会导致癌app对抗癌下载BEZ235和Obatoclax产生耐药性。

跨不同电竞信号官网的eRNA(顶部)和下载(底部)之间的关联。

这项发表在Nature Communications的最新电竞证明,许多eRNAs具有强烈的电竞类型特异性竞猜模式,eRNA或可成为电竞官网中强有力的官网或app标志物,为电竞竞技官网中app新见解。同时,该电竞发现了一系列转录因子可作为eRNA官网发生的潜在调节因子,极大地拓展了人们eRNA的认识。值得关注的是,该电竞ios建立了电竞eRNA数据库(eRic,https://hanlab.uth.edu/eRic/),允许用户下载eRNA竞猜、调控、竞猜雷火、竞技app性及下载敏感性数据信息。

参考资料:

Transcriptional landscape and clinical utility of enhancer RNAs for eRNA-targeted therapy in cancer

https://www.nature.com/articles/s41467-019-12543-5